Programmets mål var å:
- rekruttere og stimulere til forskning som kan gi ny forståelse og nye perspektiver
- stimulere til tverrfaglig og flerinstitusjonelt samarbeid innenfor samisk forskning
- ivareta og utvikle fagfelt, forskningsområder og -miljøer som til dels har svakere forskningstradisjoner enn de tradisjonelle og etablerte
- bidra til å bygge et kunnskapsgrunnlag som kan være til nytte både for samiske og norske beslutningstakere.