Verdens første sekvens av laksegenomet
I et samarbeidsprosjekt som startet i 2010 sekvenserer Norge, Canada og Chile laksens genom.
Prosjektet har nå nådd en milepæl, og Genbank har nylig lagt ut en første versjon av det som skal bli en høykvalitets referansesekvens for salmonider. Dette er det første, gove og offisielle utkastet til genomsekvens for den atlantiske laksen (et assembly). Etter hvert som prosjektet utvikles vil sekvensen bli bedre og bedre og oppdatert. Rådata fra sekvenseringen legges kontinuerlig ut og kan søkes opp.
Sekvensen er tilgjengelig på www.ncbi.nlm.nih.gov/
Velg "Nucleotide" som database å søke i. Genbank har gitt følgende informasjon om dataene:
PID Organism Accession
---------------------------------------------------
72713 Salmo salar AGKD00000000
Please cite the accession number AGKD00000000 like this:
This Whole Genome Shotgun project has been deposited at DDBJ/EMBL/GenBank under the accession AGKD00000000. The version described in this paper is the first version, AGKD01000000.
For nærmere opplysninger ta kontakt med Steinar Bergseth, stb@rcn.no
- Publisert:
- 11.11.2011
- Sist oppdatert:
- 31.08.2012